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如何使用uniprot找相似肽段?为什么不能通过补充巨噬细胞来预防癌症呢

admin admin 发表于2022-09-21 14:15:25 浏览183 评论0

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如何使用uniprot找相似肽段


1.首先打开官网,在搜索框前的单选框选择“Gene”然后在后面的搜索框输入“CD47”点击search
2.在跳出的新页面中就能看到搜索的结果了。这边我们可以看到各个物种的相关基因的链接,这边我们选择点击CD47 molecule ;
4.一直往下拉可以看到其他的信息如:基因信息、在染色体上的位置、表达分布、相互作用以及蛋白和mRNA的序列等。
肽段指多肽或蛋白质经酶消化后得到的较短的肽链。肽指的是由两个至五十个氨基酸脱水缩合形成的较短肽链。根据组成肽的氨基酸的多少,肽还可以分为寡肽和多肽。我们常说的蛋白质则是由多个多肽组合形成的生物大分子。在质谱分析多肽或蛋白质时,一般需要先将多肽或蛋白质消化成较短的肽段后再进入质谱进行分析,因此不管是多肽样品还是蛋白质样品,质谱分析的实际上都是肽段。

为什么不能通过补充巨噬细胞来预防癌症呢

不能通过补充巨噬细胞来预防癌症原因如下:

首先巨噬细胞很容易受到癌细胞伪装成健康细胞的影响,因为癌细胞能利用正常细胞所依赖的躲避免疫监视和检测的机制,这些机制会深远地增加癌细胞生长且对传统疗法抵抗的能力。

其次大多数巨噬细胞经常被利用帮助癌症生长和扩散。癌细胞经常通过表达CD47(即“不要吃我”信号)阻止巨噬细胞攻击它们。所以如果是仅仅靠补充巨噬细胞不能有效的防止的。

巨噬细胞形态:

巨噬细胞分布广泛,在疏松结缔组织内数量较多。巨噬细胞形态多样,因其功能状态不同而变化,一般为圆形或椭圆形,并有短小突起,功能活跃者常伸出较长伪足而呈不规则形。胞核较小,呈圆形或椭圆形,着色较深。

扫描电镜下,细胞表面有许多微皱褶和突起,呈彩球状。透射电镜下,胞质含有大量初级溶酶体、次级溶酶体、吞噬小泡和吞噬小体,此外还有较发达的高尔基复合体、少量线粒体和粗面内质网等。巨噬细胞在体外培养时可附着在玻璃和塑料表面,其胞质非特异性脂酶阳性,常以此收集和鉴别巨噬细胞。-i

癌症的生物学博士说要用专业点燃希望,你知道哪些关于这位博士的故事

博士简介

这位癌症的的生物学博士其实就是李治中。李治中毕业于清华大学、杜克大学,现为科普作家,担任北京大学医学院客座教授、深圳市拾玉儿童公益基金会秘书长。李治中笔名化为“菠萝”,人称菠萝博士。李治中还是中国“癌症科普网红”,他录视频、说脱口秀、写书、并用通俗易懂、轻松幽默的方式,让更多人了解肿瘤。另外他还创建了中国第一个儿童肿瘤科普网站,编写百万字科普资料。-pro

历程

  • 在2001年-2005年,李治中在清华大学就读生物系本科;
  • 在2005年-2009年,李治中在美国杜克大学就读癌症生物学博士;
  • 在2010年-2018年,李治中进入诺华制药(美国)癌症新药开发部,并成为了其中的资深研究员、实验室负责人;
  • 在2018年,李治中回国担任深圳市拾玉儿童公益基金会秘书长,并开始组建第一个项目“向日葵儿童公益”,这个项目是专注儿童癌症群体的公益团队;
  • 在2018年10月,李治中被北京大学聘为药学院客座教授。

故事与成就

  • 在2015年,李治中的著名书籍《癌症·真相:医生也在读》获得“2015中国好书”称号;
  • 在2016年,李治中获第四届中国科普作家协会优秀科普作品奖(图书类)银奖;
  • 在2018年,李治中的《癌症·新知:科学终结恐慌》荣获第五届中国科普作家协会优秀科普作品奖(图书类)金奖。与此同年9月,他还出版了《深呼吸:菠萝解密肺癌》;
  • 在2019年,李治中出版了《她说:菠萝解密乳腺癌》。与此同年,他接受了大型微纪录片《中国梦365个故事》、《名人面对面》等节目的采访;

参考文献:.新浪微博。

哺乳动物成熟红细胞中没有细胞核,编程性死亡如何进行呢

具体而言,红细胞的衰老和凋亡涉及多种凋亡途径及多条信号转导通路,与红细胞表面的多种蛋白的数量、结构和位置有着密切的联系,例如CD47、CD35 、磷脂酰丝氨酸(PS)、钙网蛋白等。这些信号分子使红细胞被标记为是否可被巨噬细胞吞噬,吞噬细胞通过识别衰老的红细胞上“吃掉我”的信号来区分衰老与正常细胞,以红细胞表面标记物CD47为例,红细胞在衰老过程中,伴随着ATP,2-3DPG的逐渐降低,胞内浓度逐渐升高,红细胞会出现棘状突起,失去一部分细胞膜,并逐渐失去生存能力,这一部分失去的细胞膜形成了囊泡,这一过程会使CD47随着囊泡丢失而不断减少。在正常情况下,CD47与吞噬细胞上的SIRPα相接触,导致ITIMs募集,引起酪氨酸磷酸化产生吞噬抑制信号在此过程中,磷酸化的SIRPα作为转接蛋白来募集和激活SHP-1或SHP-2的酷氨酸发生磷酸化传递吞噬抑制信号。-i

肿瘤免疫治疗都包括哪些啊

癌症免疫疗法,是通过增强自身免疫功能以清除肿瘤细胞的技术。癌症免疫疗法可以分为四个主要类别:非特异性免疫增强剂、疫苗、过继疗法和免疫检查点抑制剂

非特异性免疫增强剂

非特异性免疫增强剂并不专一性地针对肿瘤细胞,而是通过整体上调机体的免疫功能来获得对癌症更好的作用效果。作为最早的癌症免疫疗法,非特异性免疫增强剂早在上个世纪90年代便被应用于临床。最为常见的非特异性免疫增强剂包括白介素(Interleukins)和干扰素(Interferons)等。由于人体免疫系统扮演着识别“敌我”的功能,非特异性地上调其功能往往会造成对机体的误伤从而产生较为严重的副作用如流感样症状、皮疹、白细胞减少等,因此非特异性免疫增强剂的使用受到了局限,更多的情况下作为辅助用药与其他免疫疗法或化疗联合应用。-pro

而癌症疫苗和过继疗法、免疫检查点抑制剂作为新兴癌症免疫疗法的代表,更为受到研究者与市场的关注。在这个领域内技术迭代日新月异,不断出现的参与者逐渐形成了群雄割据的局面,资本疯狂涌入,共同构筑起人类与癌症战场的最前线。-i

疫苗

目前经美国FDA(食品药品监督管理局)批准用于癌症治疗的疫苗共有四种,分别是用于预防宫颈癌的Gardasil与 Cervarix、用于预防肝癌的乙肝疫苗和用于治疗晚期前列腺癌的Provenge。

人乳头瘤病毒HPV被认为是90%以上的宫颈癌的诱因,其中高致病性的16、18、31、33、45、52、58七类亚型可通过接种九价HPV疫苗进行预防。同样地,在中国90%以上的原发性肝癌患者均为HBsAg阳性的乙肝患者,通过接种乙肝疫苗可大大降低罹患肝癌的概率。-pro

与通过预防癌症相关病毒感染而“曲线救国”的预防性癌症疫苗不同,治疗性癌症疫苗Provenge是第一款真正意义上的癌症疫苗。这款疫苗通过分离患者的树突状细胞并在体外与特异性高表达于前列腺癌细胞的前列腺酸性磷酸酶PAP共同培养,使得树突状细胞“耳濡目染”地学会识别这一特异性抗原。在输回患者体内后,树突状细胞将PAP抗原处理并呈递给T细胞,后者则找到体内表达有PAP的前列腺癌细胞并进行扑灭。-i

除了常规的癌症疫苗外,有部分研究者也将溶瘤病毒归为癌症免疫疗法的一个分支。原本“无恶不作”的病毒经基因改造后能够特异性地感染肿瘤细胞,通过在细胞内大量复制杀伤肿瘤,这一过程中释放出的肿瘤细胞抗原则能够引起免疫反应来强化溶瘤病毒的治疗效果。溶瘤病毒应用上最大的障碍在于其本身也是免疫系统的目标之一,因此往往需要采用瘤内注射或联合免疫抑制剂使用。而在一些处于临床早期的溶瘤病毒产品中,已经开始尝试着采用静脉注射这一常规给药途径,希望能够进一步拓展溶瘤病毒的应用前景。-pro

过继细胞疗法

1984年,Linda Taylor来到美国国家癌症研究院,寻求治疗她所罹患的晚期转移性恶性黑色素瘤的方法。癌症免疫学家Steven Rosenberg接待了她。在分离了一部分Taylor的淋巴细胞后,研究人员将大剂量的IL-2用于刺激淋巴细胞,并把得到的淋巴因子活化杀伤细胞(LAK cell)输回到她体内。Taylor的病情逐渐稳定并恢复。-i

近30年来,历史也见证了过继细胞疗法从第一代的LAK疗法,经细胞因子活化杀伤细胞CIK疗法、肿瘤浸润淋巴细胞TIL疗法、细胞毒性T淋巴细胞CTL疗法到第五代嵌合抗原受体T细胞CAR-T和肿瘤特异性T细胞受体基因工程细胞TCR-T的技术变革。Juno Therapeutics的CAR-T候选疗法JCAR015的I期临床结果显示,有91%的成年急性淋巴细胞白血病患者经JCAR015治疗后获得了完全缓解,尽管总生存期的延长并不显著,但所有人都对这种结合了基因工程和细胞疗法的崭新技术给予了厚望。-pro

T淋巴细胞对肿瘤细胞的识别依赖于T细胞受体TCR与肿瘤细胞表面MHC-抗原复合物的结合,而许多肿瘤细胞在不断的“进化”过程中形成了通过降低MHC表达等手段逃避T细胞识别的能力。针对这一困境,研究者们一方面通过基因突变和筛选寄希望于找到与MHC-抗原复合物具有高亲和力的基因工程TCR,另一方面试图通过让T细胞表达能绕过MHC直接结合肿瘤细胞表面抗原的受体来将T细胞“锚定”在肿瘤细胞上。这两种不同的研究方向分别催生了TCR-T和CAR-T的诞生。-i

TCR-T技术作为传统过继细胞疗法技术的延伸,其识别肿瘤抗原的能力依赖于表达于抗原呈递细胞表面的主要组织相容性复合物(MHC),这在一定程度上限制了它在不同人群间的应用广度和整体效果。但TCR-T最大的优势在于其不但识别肿瘤细胞表面抗原,对于肿瘤细胞内的抗原同样能够通过MHC的提递而进行识别,这使得其针对的肿瘤类型相对于CAR-T要广得多。-pro

第五代过继细胞疗法的光芒虽然耀目,但就目前而言它依然无法撼动手术、化疗和放疗在肿瘤治疗领域的统治地位。在临床试验中CAR-T同样暴露出了许多亟需改善的问题和症结,如不明原因的疾病复发、致命的细胞因子风暴等等。-i

单克隆抗体类免疫检查点(immune checkpoint inhibitor)抑制剂

抗程序性死亡蛋白1(programmed death 1, PD-1)抗体是目前研究最多,临床发展最快的一种免疫疗法。PD-1起作用在免疫反应的效应阶段,其表达于活化的T细胞,B细胞及髓系细胞,其有两个配体,即程序性死亡分子配体-1(programmed death ligand 1, PD-L1)和PD-L2。PD-L1/L2在抗原提呈细胞都表达,PD-L1在多种组织也有表达。PD-1与PD-L1的结合介导T细胞活化的共抑制信号,抑制T细胞的杀伤功能,对人体免疫应答起到负调节作用。华裔科学家陈列平实验室首先发现PD-L1在肿瘤组织高表达,而且调节肿瘤浸润CD8+ T细胞的功能。因此,以PD-1/PD-L1为靶点的免疫调节对抗肿瘤有重要的意义。 -pro

PD-1/PD-L1抑制剂能够特异性地和肿瘤细胞上的PD-L1结合来抑制其表达,从而能够使功能受抑制的T细胞恢复对肿瘤细胞的识别功能,从而实现通过自身免疫系统达到抗癌作用。

近年来,已有多种PD-1/PD-L1单克隆抗体在肿瘤免疫治疗的临床研究迅速开展。目前PD-1抑制剂Pembrolizumab和Nivolumab已被FDA批准用于晚期黑色素瘤、非小细胞肺癌、霍奇金淋巴瘤和头颈鳞癌等,Nivolumab还被FDA批准可用于治疗肾癌和尿路上皮癌等。此外,PD-L1抑制剂Atezolizumab和Durvalumab等单克隆抗体也已进入多个III期临床研究中,覆盖非小细胞肺癌、黑色素瘤、膀胱癌等多个瘤种。-i

细胞毒性T淋巴细胞抗原4(cytotoxic T-lymphocyte antigen 4, CTLA-4)是表达于活化的T细胞表面的一种跨膜蛋白。CTLA-4作用于免疫反应的启动阶段,其激活能够抑制T细胞免疫应答的启动,从而导致活化的T细胞减少并阻止记忆性T细胞的生成。研究发现,肿瘤细胞能够激活CTLA-4,使活化的T细胞失去活性,从而实现了肿瘤自身的免疫逃逸(immune escape)。-pro

数个临床前研究发现,阻断CTLA-4后能够恢复T细胞的活性并延长记忆性T细胞的存活时间,从而恢复身体对肿瘤细胞的免疫功能,使得肿瘤的控制率提高,据此研发了抗CTLA-4 的特异性单克隆抗体。 

目前两种CTLA-4抑制剂Ipilimumab已被FDA批准用于III期黑色素瘤的辅助治疗和晚期黑色素瘤的治疗, 而Ipilimumab和Tremelimumab在肾癌、前列腺癌、肺癌等的临床研究已广发开展。早期期临床研究结果显示两种单抗无论是单药还是联合IL-2、PD-1/PD-L1抑制剂或化疗均显示安全有效。-i

其它如增强T细胞第二信号从而促进肿瘤特异性T细胞活化和增殖的单抗类,如肿瘤坏死因子TNF受体家族的OX40和4-1BB单抗尚在研发中。

2014年末,Science杂志对2015年科技的重要突破做出了预测,联合免疫疗法也在其中。早在上个世纪人们就意识到,癌症远远不是源自正常细胞一个基因、一个蛋白的改变,联合疗法才是癌症治疗的关键。上海敦复医院是上海第一批开展肿瘤免疫治疗的医院,目前已经为2500人次提供了肿瘤免疫治疗,如果你有肿瘤免疫治疗需求,请联系我们》》40 08 9 99 8 200-pro

医药学发展的基石是生命科学,随着对肿瘤生成发展现象的研究不断深入和突破,疾病治疗手段将更加丰富多样。在不远的未来,针对高效低毒的新型肿瘤靶点的药物研发、细胞疗法的安全性和经济性改造、克服耐药性的联合用药方案以及以预防和早期发现为主的精准医疗将是癌症治疗领域最为引人关注的方向。而免疫治疗恰恰是最为有希望的关键点!-i

NCBI基因序列,这个棕色的代表什么以及这Detail指的是


棕色的是你选取的序列,从这张截图左下角显示猜测可能是这个基因CDS序列,也就是这个基因的编码序列。
Detail显示的是这段棕色标注序列的详细信息,从这张截图里能看出来这段序列是该基因第73位碱基到第1047位碱基的一段序列,编码的蛋白是“integrin-associated protein”,编码产物名称叫“CD47”(integrin-associated protein和CD47是同一个的东西的两个名字),蛋白ID是“BAA25401.1”,后面那一大串大写字母是这段棕色标注的DNA序列翻译出来的蛋白的氨基酸全序列信息。
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重生细胞万灵药谁研发的


威廉斯尼亚坦福。美国加州斯坦福大学医学院的科学家威廉斯尼亚坦福近日研制出一种万灵药,能够有效治疗任何一种癌症肿瘤。这种药物为CD47蛋白质的抗体,可以阻断CD47蛋白质的作用,让免疫系统直接对恶性肿瘤细胞展开攻击。因而被称为重生细胞万灵药。
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淋巴瘤应当要怎样治疗


常用的治疗手段如下:
1.放射治疗
某些类型的淋巴瘤早期患者可以选择单纯放疗。放疗还可用于系统化疗后巩固治疗及移植时辅助治疗。
2.手术治疗
淋巴瘤手术治疗多适用于没有局部发作和远处复发转移,瘤体较小且患者身体状况良好的情况,特别是早期患者更为适宜;对于中晚期淋巴瘤患者来说,如果原发灶已经切除,转移灶又单一,身体状况较好也可以进行转移灶的切除。
3.化学药物治疗
淋巴瘤治疗多采用联合化疗,也可以结合靶向治疗药物和生物制剂等,如免疫药物治疗、或免疫细胞治疗等。
4.造血干细胞移植治疗
在恶性淋巴瘤的治疗中,最常用的是自体外周血造血干细胞移植,或自体骨髓移植,少数患者可考虑用异基因造血干细胞移植治疗。
5. 靶向药物治疗
相比于化疗,靶向药物能更精确地对淋巴瘤细胞起作用,从而在有效治疗的同时减少不良反应。利妥昔单抗是第一种用于治疗淋巴瘤的靶向治疗药物,还有许多其他靶向药物用于淋巴瘤患者的治疗,一些已经获批上市,而另一些还处在临床试验阶段。
6. 免疫治疗
PD-1/PD-L1抗体免疫治疗在淋巴瘤治疗领域成绩也是十分可观的,即使是多线治疗失败的复发难治性淋巴瘤,PD-1/PD-L1抗体治疗仍然收获不错的疗效。其他免疫检查点抑制剂,如抗CD47单抗、LAG-3通路抑制剂等在淋巴瘤治疗中也显示不错的疗效。
嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)是近年来最火的免疫疗法之一,CAR-T细胞疗法提取患者自身的关键免疫细胞——T细胞,给它嵌入一种嵌合抗原受体(CAR),该受体能够在识别肿瘤细胞表面抗原的同时,激活T细胞杀死肿瘤细胞。该治疗在淋巴瘤领域也取得了不错的疗效。
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脑部胶质瘤的巨噬细胞能“吃掉”肿瘤

据了解,合成SIRPα蛋白(CV1单核细胞)和抗癌药物利妥昔单抗的双重打击下体内的肿瘤在29天后被清除。为了避免被免疫系统破坏,癌细胞耍了一些小手段。当它们分裂形成肿瘤时,会避免让巨噬细胞察觉到,巨噬细胞是从事消灭死亡细胞和危险入侵者的免疫细 胞。现在,许多癌症患者都在利用抗体药物进行治疗,这些抗体药物的部分作用是标识肿瘤细胞以便让巨噬细胞消灭它们。尽管这些药物可以延长患者的生命,但它 们并不总是非常有效——部分原因在于癌细胞会通过给免疫细胞发送一个“别吃我”的信号进行反击。现在,研究人员已经在小鼠身上设计出一种小型蛋白质,它可 以截断这一信号,并且能大幅度地提高抗体药物的效力以使肿瘤萎缩。  我们先了解下什么是巨噬细胞?巨噬细胞(英语:Macrophages,缩写为mø)是一种位于组织内的白血球,源自单核细胞,而单核细胞又来源于骨髓中的前体细胞。巨噬细胞和单核细胞皆为吞噬细胞,在脊椎动物体内参与非特异性防卫(先天性免疫)和特异性防卫(细胞免疫)。它们的主要功能是以固定细胞或游离细胞的形式对细胞残片及病原体进行噬菌作用(即吞噬以及消化),并激活淋巴球或其他免疫细胞,令其对病原体作出反应。  美国加州帕洛阿尔托斯坦福大学的干细胞生物学家Irving Weissman一直在研究一种负责传播“别吃我”信号的蛋白质。这种蛋白质被称为CD47,它可以保护白血病细胞和其他癌细胞免受巨噬细胞的吞噬。去 年,Weissman的研究小组报告称,一种在肿瘤细胞中阻断CD47的抗体可以刺激小鼠的巨噬细胞摧毁肿瘤。加州再生医学研究所将提供2000万美元基 金用于在不久的将来测试这种反CD47抗体在人体中的安全性。  虽然这种方法很有潜力,但这种抗体也有一定的缺点——相对较大的尺寸限制了它们穿透肿瘤的能力。另外,它们存在毒副作用,因此Weissman的团 队与结构生物学家Christopher Garcia在斯坦福大学的实验室合作测试了另外一种阻断CD47的方式。Garcia的团队和Weissman近日在《科学》杂志网络版上描述了他们的 新研究。  研究人员合作的开始是研究一种被称为SIRPα的蛋白,这种蛋白从巨噬细胞的表面伸出并与CD47连接以接受肿瘤细胞发出的“别吃我”信号。他们的 想法就是利用自由浮动、合成形式的SIRPα锁定CD47,这样的设计是为了让巨噬细胞上真正的SIRPα搭不上癌细胞,从而不会让巨噬细胞被蒙蔽而放过 癌细胞。Garcia的实验室合成了许多版本的SIRPα蛋白,确定了它们的结构,最终发现了两种形式的蛋白,它们比天然SIRPα受体绑定CD47的程 度要高出5万倍。  将这两种蛋白添加到同时具备癌症细胞和巨噬细胞的一个培养皿中后,研究人员发现合成SIRPα蛋白并没有起什么作用——巨噬细胞仍然无视癌细胞的存在。然而,当研究人员把肿瘤特异性抗体药物投入到培养皿中时——他们发现投入抗体性药物可以让巨噬细胞注意到癌细胞,这样的组合给了培养皿中的癌细胞以及 植入到小鼠体内的癌细胞一记重拳。例如,在单一地给予药物利妥昔单抗或SIRPα蛋白时,小鼠体内的淋巴瘤只会放慢发展的速度,相比之下,在治疗中将药物 和SIRPα蛋白结合起来,则使得大多数小鼠体内的肿瘤在最少7个月的时间里便几乎全部消失了。将SIRPα添加到治疗乳腺癌的药物曲妥珠单抗中,可以加 快乳腺癌小鼠肿瘤的萎缩速度。Garcia解释说:“SIRPα削弱了癌症细胞保护其自身免受破坏的能力。”  荷兰阿姆斯特丹大学的细胞生物学家Timo van den Berg补充道:“这些数据是相当令人信服的,也令人非常兴奋。”因为人体大多数的细胞都会表达CD47,这些细胞会吸收SIRPα蛋白质,而使肿瘤细胞 接触到足够的SIRPα蛋白质变得困难。他的研究小组正致力于研究一种能够阻断主要出现在巨噬细胞中的SIRPα受体的抗体,这种方法是防止免疫细胞接收 到癌细胞欺骗性消息的一条途径。Garcia回应道,虽然他认为他的团队所研究的方法将在病人身上取得很好的疗效,但“从另一个方向对这种信息进行阻断也 是一个可行的策略,而且值得人们去研究”。-i